目前很多的地区都已经施行了多证合一的公司注册制度，但是还是有很多的地方还是由老的注册制度。深圳就是属于新的多证合一的注册公司，那么深圳公司注册后如何注销公司？
1、尚未进行营业执照变更的企业该如何进行注销？我国为企业更换新版营业执照留有过渡期，企业只要在2015年10月1日至2017年10月1日这段时间内完成变更即可。在过渡期内未进行多证合一营业执照更换的企业，按照原规定进行企业注销手续办理即可。
2、改革后新成立的或已变更证照的企业，进行企业注销有什么需要注意的地方？
（1）多证合一后企业进行注销登记时，需要向税务主管机关进行清税申报，填写《清税申报表》。
（2）清税申报需要分别向国税、地税税务主管机关提交申请，但没有顺序要求，企业可任意选择一方先进行清税申报。
（3）一方税务机关受理后，需将企业清税申报信息同时传递给另一方税务机关。
（4）清税完毕后，税务机关需及时将清税结果反馈给受理税务机关。受理税务机关会对国、地税具的清税结果进行审核评估，审核通过后会向纳税人统一出具《清税证明》。
（5）税务机关在处理纳税人清税申报时，若发现纳税人存在疑点，企业可以提供税务中介服务机构出具的鉴证报告来证明企业的清白。
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