分公司注册的时候税务分为非独立核算和独立核算，独立核算和普通的公司一样进行记账报税，而非独立核算的分公司却有些麻烦。那么非独立核算分公司如何纳税？
非独立核算分公司不属于独立核算的纳税人，财务并入总公司统一核算管理，要建立有关辅助帐、明细帐，具体根据总公司要求确定。
国税这块，经总公司主管税务机关同意后，分公司实行增值税预征，然后由总公司统一抵扣； 营业税按公司所属地分别缴纳。如果分公司与总公司经营的业务相同，分公司实行报帐制度，同时要在所属地办理相关证照。
非独立核算，指的是分公司不能单独开立基本账户，不能单独领用发票，可以在总公司下设单独账户，统一纳税。
非独立核算又称报帐制，是把本单位的业务经营活动有关的日常业务资料，逐日或定期报送上级单位，由上级单位进行核算。
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